离子色谱法主要用于环境样品的分析，包括地表水、饮用水、雨水、生活污水和工业废水中的阴离子和阳离子，酸性沉积物和大气颗粒，以及水中的微量杂质和与微电子工业有关的试剂的分析。离子色谱仪与传统的离子交换色谱柱色谱法不同，主要原因是树脂的交联度高，交换能力低，进样量非常小。当洗脱液由柱塞泵输送时，通常要对洗脱液进行在线自动连续电导检测。
离子色谱仪的日常维护是预防和减少仪器故障发生率的重要手段。色谱仪发生故障的原因是多种多样的，因此要结合自身的工作经验进行认真仔细的故障排除，确定引起故障的具体部件，并有针对性地加以解决。仪器分析方法仪器的性能几乎决定了一切，操作水平高的分析人员在有质量问题的仪器上无法获得理想的监测数据。因此，加强对色谱仪的日常维护，加强对仪器使用中常见问题的解决方法的经验交流和探讨是相当必要的。只有在色谱仪的正常状态下，才能保证分析结果的准确性和可靠性。
分离柱是离子色谱仪的核心部件之一。样品中各种离子的分离是在分离柱中完成的。分离性能主要取决于分离柱的分离效率，因此，分离柱的维护是极其重要的。
1、分离柱的保养
分离柱在任何情况下都不得发生碰撞、弯曲或强烈振动。在测定过程中，实际样品应进行预处理。分析样品不应含有悬浮物、大量的有机物、大量的重金属离子等。分离柱怕细菌、腐植酸和可溶性硅，所以用的水必须是蒸馏水，不能用电渗析水。如果短时间内不使用，应启动，每隔5-6天供一次水，以保持分离柱的性能；如果不使用，应按厂家的说明加注液体，密封保存。
2、分离柱的死体积
分离柱两端的死体积会导致峰的扩大或分裂（出现双峰）。分离柱通常用玻璃珠（直径小于100um）填充以提高分离效率。
3、分离柱的保养分离柱的再生
如果分离柱的分离性能下降，可以根据制造商的说明对分离柱进行再生。对于以硅胶为填料的分离柱，必须用pH2-7的溶液进行再生，否则，分离柱会被损坏。
